| พ.ค. 2567 – ปัจจุบัน | รศ.ดร. ศราวุธ แรมจันทร์ | ผู้อำนวยการสำนักงานศูนย์ฯ |
| ก.พ. 2568 – ปัจจุบัน | ผศ.ดร.ปิยะ เตชะธีราวัฒน์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| พ.ค. 2567 – ปัจจุบัน | รศ.ดร. วิชัย วิทยาเกียรติเลิศ | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารและปฏิบัติการ |
| |
| พ.ค. 2567 – ม.ค. 2568 | รศ. ดร. ธนาธร ทะนานทอง | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| | |
| ต.ค. 2565 – พ.ค. 2567 | รศ.ดร.ชาลี เจริญลาภนพรัตน์ | ผู้อำนวยการสำนักงานศูนย์ฯ |
| ต.ค. 2565 – พ.ค. 2567 | รศ.ดร.วิชัย วิทยาเกียรติเลิศ | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารและปฏิบัติการ |
| |
| พ.ค. 2565 – ต.ค. 2565 | รศ.ดร.จิรพล สังข์โพธิ์ | รักษาการแทนในตำแหน่งผู้อำนวยการสำนักงานศูนย์ฯ |
| พ.ค. 2565 – ต.ค. 2565 | รศ.ดร.วิชัย วิทยาเกียรติเลิศ | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารและปฏิบัติการ |
| |
| ธ.ค. 2561 – พ.ค. 2565 | อาจารย์ ดร.ปกป้อง ส่องเมือง | ผู้อำนวยการสำนักงานศูนย์ฯ |
| ต.ค. 2562 – พ.ค. 2565 | รศ.ดร.วิชัย วิทยาเกียรติเลิศ | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารและปฏิบัติการ |
| พ.ค. 2562 – ต.ค. 2562 | อาจารย์ ดร.ปานนท์ ลาชโรจน์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| |
| ต.ค. 2560 – ธ.ค. 2561 | อาจารย์ ดร.ปกป้อง ส่องเมือง | ผู้อำนวยการสำนักงานศูนย์ฯ |
| ต.ค. 2560 – ธ.ค. 2562 | ผศ. ดร.พีระศักดิ์ อินทรไพบูลย์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารและปฏิบัติการ |
| พ.ค. 2561 – มี.ค. 2562 | รศ. ดร.มนตรี วิบูลยรัตน์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| |
| ก.ย. 2554 – 2560 | ผู้ช่วยศาสตราจารย์ โปรดปราน สิริธีรศาสน์ | ผู้อำนวยการสำนักงานศูนย์ฯ |
| | รองศาสตราจารย์ ดร.สาธก ไชยกุลชื่นสกุล | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารและปฏิบัติการ |
| |
| ก.ย. 2554 – 2557 | อาจารย์เกษมชาต ศรีวาลัย | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| |
| 2557 – ปัจจุบัน | ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ดร.วิรัตน์ จารีวงศ์ไพบูลย์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| |
| เม.ย. 2551 – 2554 | รองศาสตราจารย์ ปกรณ์ เสริมสุข | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ประวิทย์ เรืองไรรัตนโรจน์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายปฏิบัติการ |
| |
| เม.ย. 2548 – 2551 | รองศาสตราจารย์ ปกรณ์ เสริมสุข | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ดร. อรุณ ลาวัณย์ประเสริฐ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิศวกรรมและปฏิบัติการ |
| | อาจารย์ ดร. ทรงศักดิ์ รองวิริยะพานิช | รองผู้อำนวยการฝ่ายพัฒนาระบบสารสนเทศ |
| |
| เม.ย. 2545 – 2548 | นายไพโรจน์ เบญจมานนท์ | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | นายเอกรินทร์ ศิวิลัย | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหาร |
| | นายรุ่งศักดิ์ พรหมแย้ม | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| | นายสถาพร ก่อรักเศวต | รองผู้อำนวยการฝ่ายระบบสารสนเทศ |
| |
| 2542 – 2545 | ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ดร. สมนึก ประภารธนาธร | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| 2542 | อาจารย์พงษ์ศักดิ์ มหาโชคเลิศวัฒนา | รองผู้อำนวยการฝ่ายระบบสารสนเทศ |
| 2542 | อาจารย์ศิริรัตน์ ภววงษ์ศักดิ์ | ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| 2542 – 2544 | นายไพโรจน์ เบญจมานนท์ | ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายบริหาร |
| 2542 – 2545 | อาจารย์ชุมพล บุญมี | ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| 2542 – 2545 | อาจารย์นาวิน สมญาติ | ผู้ช่วยผู้อำนวยการฝ่ายระบบสารสนเทศ |
| 2544 – 2545 | นายไพโรจน์ เบญจมานนท์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหาร |
| |
| 2541 – 2542 | อาจารย์ ม.ร.ว.พงษ์สวัสดิ์ สวัสดิวัตน์ | รษก.ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | อาจารย์วันชัย ขันตี | รษก.รองผู้อำนวยการฝ่ายระบบสารสนเทศ |
| | อาจารย์ ดร.โกวิท ชาญวิทยาพงศ์ | รษก.รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| | อาจารย์นรินทร์ วัฒนกุล | รษก.รองผู้อำนวยการฝ่ายปฏิบัติการ ศูนย์รังสิต |
| |
| 2538 – 2541 | อาจารย์ ม.ร.ว.พงษ์สวัสดิ์ สวัสดิวัตน์ | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | อาจารย์วันชัย ขันตี | รองผู้อำนวยการฝ่ายระบบสารสนเทศ |
| 2538 – 2540 | ผศ. ดร.สกนธ์ วรัญญูวัฒนา | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| 2540 – 2541 | อาจารย์ ดร.โกวิท ชาญวิทยาพงศ์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| | อาจารย์นรินทร์ วัฒนกุล | รองผู้อำนวยการฝ่ายปฏิบัติการ ศูนย์รังสิต |
| |
| 2536 – 2538 | รศ. ดร.สุรพงษ์ โสธนะเสถียร | ผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการ |
| | อาจารย์ ดร.ประณิต ภูมิถาวร | รองผู้อำนวยการสถาบัน |
| |
| 2535 – 2536 | รศ. ดร. ธเนตร นรภูมิพิภัชน์ | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | อาจารย์ ดร. ทวีศักดิ์ กออนันตกูล | รษก. รองผู้อำนวยการฝ่ายวิศวกรรมและปฏิบัติการ |
| | อาจารย์เขมา เวสารัชช์ | รษก. รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการและสหการ |
| | อาจารย์วันชัย ขันตี | รษก. รองผู้อำนวยการฝ่ายวิเคราะห์และพัฒนาระบบ |
| |
| 2532 – 2535 | รศ. ดร. ธเนตร นรภูมิพิภัชน์ | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | อาจารย์ ดร. ทวีศักดิ์ กออนันตกูล | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิศวกรรมและปฏิบัติการ |
| | อาจารย์เขมา เวสารัชช์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการและสหการ |
| | ม.ร.ว.พงษ์สวัสดิ์ สวัสดิวัตน์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิเคราะห์และพัฒนาระบบ |
| 2535 | อาจารย์วันชัย ขันตี | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิเคราะห์และพัฒนาระบบ |
| |
| 2529 – 2532 | รศ. ดร. ธเนตร นรภูมิพิภัชน์ | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| 2532 | อาจารย์พีระพงษ์ รัตนกฤษฎาธาร | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิเคราะห์และพัฒนาระบบ |
| | อาจารย์ ดร. ทวีศักดิ์ กออนันตกูล | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิศวกรรมและปฏิบัติการ |
| | อาจารย์เขมา เวสารัชช์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการและสหการ |
| | ม.ร.ว.พงษ์สวัสดิ์ สวัสดิวัตน์ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิเคราะห์และพัฒนาระบบ |
| |
| 2525 – 2529 | รศ. ดร. ธเนตร นรภูมิพิภัชน์ | ผู้อำนวยการสถาบันฯ |
| | อาจารย์พีระพงษ์ รัตนกฤษฎาธาร | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิเคราะห์และพัฒนาระบบ |
| | อาจารย์ประโยชน์ ธรรมกรบัญญัติ | รองผู้อำนวยการฝ่ายวิชาการและสหการ |